ما زال هناك وجود للنينجا في اليابان في الوقت الحالي، حيث يبلغ عددهم حوالي 200,000 نينجا. وتُدير منظمة الاستخبارات الوطنية للنينجا (NIN) عملياتها بشكل مستقل وغير تابعة للحكومة المدنية، حيث يُنفَّذ أعضاؤها المتميزين بأعمال اغتيال وتخريب بسرية تامة. ومع ذلك، توجد منظمة تُعارِض NIN وتُعرف بـ UN (Under Ninja). هذا الصراع السري بين النينجا والنينجا: ما هو السر الذي يكمن وراءه؟